Asistir al Rector de la Universidad Nacional del Alto Uruguay, entender en la planificación, programación económico-financiera, entender en lo que respecta a los bienes patrimoniales, racionalizando y distribuyendo los recursos económicos de la institución de acuerdo a las necesidades, gestionar las tareas operativas administrativas internas de la Universidad Nacional del Alto Uruguay sin dejar de observar las políticas y objetivos fijados por el Rector, a quien asesora en cuestiones administrativas y financieras.
El Secretario de Hacienda y Administración es la persona encargada de entender en la programación, administración general de los recursos económicos-financieros y humanos de la Universidad y la gestión administrativa integral de la UNAU. Proyecta los presupuestos e informes necesarios en los distintos niveles dentro y fuera del ámbito universitario
